Il percorso dell'Enciclopedia si articola in sei tappe corrispondenti a sei scienze paradigmatiche o esemplari. Ognuna di queste sei tappe (scienze) è scandita da nove figure: l'iscritto e circoscritto, il pensiero e le pratiche, l'origine, la diffidenza, la trascendenza, l'analogia, l'incontro, l'occasione, la verità.