II cataclisma di Gotham ha riempito la città di Blüdhaven di centinaia di rifugiati in fuga dalla Terra di Nessuno che è divenuta la loro città. Nightwing si allea con il suo mentore, Batman, nella speranza che riportare l'ordine a Gotham significhi riportarlo a Blüdhaven. Nella sua missione in solitario nella prigione di Blackgate, Nightwing si troverà davanti a orrori indescrivibili. Nightwing: II lato oscuro della giustizia vede il nostro eroe incontrare i più grandi eroi e criminali dell'Universo DC, fra cui Superman, Oracolo, la Cacciatrice, Blockbuster e Batman e continua la saga dell'alleato di sempre dell'Uomo Pipistrello nel suo tentativo di costruirsi una nuova vita.