Nel bel mezzo dell'epoca Edo, quella dei grandi samurai, piombano dal cielo degli alieni chiamati Amanto che conquistano la Terra. La casta dei samurai viene abolita e i nobili guerrieri privati della spada. Tuttavia, qualcuno non è disposto ad accettare questa imposizione: si tratta di Gintoki Sakata, ragazzaccio ribelle e impulsivo, che con un gruppo di amici cerca di tirare avanti senza tradire i principi del vero samurai... A seguito di una temporanea sospensione nella pubblicazione della serie, Shinpachi torna all'Agenzia Tuttofare e... si ritrova catapultato nel futuro di due anni! A partire da Gintoki e Kagura, niente e nessuno è più come prima! Ma sotto il cielo di Edo si possono osservare altre stranezze, come lo Shogun in piscina, un'imbarazzante lotta per accaparrarsi dei pezzi di granchio, e tanto altro!